Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
NME3Q13232 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
NME3Q13232 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
NME3Q13232 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
NME3Q13232 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
NME3Q13232 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
NME3Q13232 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
NME3Q13232 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
NME3Q13232 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
NME3Q13232 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
NME3Q13232 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
NME3Q13232 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
NME3Q13232 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
NME3Q13232 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
NME3Q13232 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
NME3Q13232 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
NME3Q13232 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
NME3Q13232 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
NME3Q13232 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
NME3Q13232 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
NME3Q13232 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
NME3Q13232 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
NME3Q13232 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
NME3Q13232 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
NME3Q13232 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
NME3Q13232 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
NME3Q13232 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
NME3Q13232 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
NME3Q13232 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
NME3Q13232 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
NME3Q13232 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
NME3Q13232 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
NME3Q13232 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.26
NME3Q13232 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
NME3Q13232 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NME3Q13232 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NME3Q13232 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NME3Q13232 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NME3Q13232 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NME3Q13232 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NME3Q13232 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NME3Q13232 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NME3Q13232 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NME3Q13232 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NME3Q13232 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NME3Q13232 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NME3Q13232 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NME3Q13232 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NME3Q13232 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NME3Q13232 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NME3Q13232 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NME3Q13232 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
NME3Q13232 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
NME3Q13232 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NME3Q13232 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NME3Q13232 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NME3Q13232 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.89□□□□□ -2.27
NME3Q13232 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
NME3Q13232 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
NME3Q13232 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NME3Q13232 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NME3Q13232 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NME3Q13232 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
NME3Q13232 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NME3Q13232 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NME3Q13232 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
NME3Q13232 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
NME3Q13232 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NME3Q13232 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NME3Q13232 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NME3Q13232 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NME3Q13232 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NME3Q13232 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NME3Q13232 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NME3Q13232 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NME3Q13232 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NME3Q13232 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NME3Q13232 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NME3Q13232 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NME3Q13232 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NME3Q13232 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NME3Q13232 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NME3Q13232 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NME3Q13232 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NME3Q13232 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NME3Q13232 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.88□□□□□ -2.27
NME3Q13232 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
NME3Q13232 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NME3Q13232 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NME3Q13232 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NME3Q13232 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NME3Q13232 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NME3Q13232 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NME3Q13232 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NME3Q13232 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NME3Q13232 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NME3Q13232 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NME3Q13232 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NME3Q13232 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NME3Q13232 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110 ms