Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.2
CHAF1BQ13112 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CHAF1BQ13112 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CHAF1BQ13112 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CHAF1BQ13112 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CHAF1BQ13112 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CHAF1BQ13112 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CHAF1BQ13112 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CHAF1BQ13112 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CHAF1BQ13112 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
CHAF1BQ13112 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
CHAF1BQ13112 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CHAF1BQ13112 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CHAF1BQ13112 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CHAF1BQ13112 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CHAF1BQ13112 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CHAF1BQ13112 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CHAF1BQ13112 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
CHAF1BQ13112 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHAF1BQ13112 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHAF1BQ13112 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHAF1BQ13112 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHAF1BQ13112 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHAF1BQ13112 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHAF1BQ13112 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHAF1BQ13112 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
CHAF1BQ13112 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CHAF1BQ13112 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CHAF1BQ13112 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CHAF1BQ13112 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CHAF1BQ13112 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CHAF1BQ13112 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CHAF1BQ13112 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CHAF1BQ13112 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CHAF1BQ13112 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CHAF1BQ13112 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CHAF1BQ13112 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CHAF1BQ13112 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CHAF1BQ13112 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CHAF1BQ13112 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CHAF1BQ13112 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CHAF1BQ13112 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CHAF1BQ13112 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CHAF1BQ13112 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CHAF1BQ13112 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHAF1BQ13112 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHAF1BQ13112 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHAF1BQ13112 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHAF1BQ13112 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHAF1BQ13112 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHAF1BQ13112 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHAF1BQ13112 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHAF1BQ13112 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHAF1BQ13112 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHAF1BQ13112 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHAF1BQ13112 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHAF1BQ13112 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHAF1BQ13112 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHAF1BQ13112 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CHAF1BQ13112 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CHAF1BQ13112 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
CHAF1BQ13112 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHAF1BQ13112 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHAF1BQ13112 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHAF1BQ13112 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHAF1BQ13112 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHAF1BQ13112 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHAF1BQ13112 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CHAF1BQ13112 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CHAF1BQ13112 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
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