Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTP4A2Q12974 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTP4A2Q12974 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTP4A2Q12974 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTP4A2Q12974 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTP4A2Q12974 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTP4A2Q12974 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTP4A2Q12974 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTP4A2Q12974 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTP4A2Q12974 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTP4A2Q12974 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTP4A2Q12974 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTP4A2Q12974 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTP4A2Q12974 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTP4A2Q12974 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
PTP4A2Q12974 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTP4A2Q12974 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
PTP4A2Q12974 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
PTP4A2Q12974 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PTP4A2Q12974 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
PTP4A2Q12974 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTP4A2Q12974 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTP4A2Q12974 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTP4A2Q12974 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTP4A2Q12974 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTP4A2Q12974 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTP4A2Q12974 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTP4A2Q12974 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PTP4A2Q12974 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PTP4A2Q12974 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTP4A2Q12974 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTP4A2Q12974 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTP4A2Q12974 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTP4A2Q12974 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTP4A2Q12974 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTP4A2Q12974 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
PTP4A2Q12974 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTP4A2Q12974 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTP4A2Q12974 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTP4A2Q12974 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTP4A2Q12974 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTP4A2Q12974 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTP4A2Q12974 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTP4A2Q12974 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTP4A2Q12974 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTP4A2Q12974 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTP4A2Q12974 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTP4A2Q12974 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTP4A2Q12974 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
PTP4A2Q12974 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTP4A2Q12974 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTP4A2Q12974 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTP4A2Q12974 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTP4A2Q12974 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTP4A2Q12974 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTP4A2Q12974 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTP4A2Q12974 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTP4A2Q12974 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTP4A2Q12974 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTP4A2Q12974 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTP4A2Q12974 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTP4A2Q12974 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTP4A2Q12974 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTP4A2Q12974 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTP4A2Q12974 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTP4A2Q12974 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PTP4A2Q12974 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTP4A2Q12974 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTP4A2Q12974 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTP4A2Q12974 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTP4A2Q12974 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTP4A2Q12974 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTP4A2Q12974 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTP4A2Q12974 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTP4A2Q12974 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTP4A2Q12974 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTP4A2Q12974 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTP4A2Q12974 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTP4A2Q12974 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTP4A2Q12974 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTP4A2Q12974 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTP4A2Q12974 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTP4A2Q12974 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTP4A2Q12974 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTP4A2Q12974 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTP4A2Q12974 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTP4A2Q12974 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTP4A2Q12974 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTP4A2Q12974 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTP4A2Q12974 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTP4A2Q12974 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTP4A2Q12974 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTP4A2Q12974 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PTP4A2Q12974 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTP4A2Q12974 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTP4A2Q12974 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTP4A2Q12974 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTP4A2Q12974 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PTP4A2Q12974 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PTP4A2Q12974 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
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