Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
STX4Q12846 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
STX4Q12846 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
STX4Q12846 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
STX4Q12846 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
STX4Q12846 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
STX4Q12846 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
STX4Q12846 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
STX4Q12846 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
STX4Q12846 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
STX4Q12846 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
STX4Q12846 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
STX4Q12846 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC0.07□□□□□ -2.4
STX4Q12846 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
STX4Q12846 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
STX4Q12846 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
STX4Q12846 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC0.07□□□□□ -2.4
STX4Q12846 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC0.07□□□□□ -2.4
STX4Q12846 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
STX4Q12846 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
STX4Q12846 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
STX4Q12846 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
STX4Q12846 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
STX4Q12846 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
STX4Q12846 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
STX4Q12846 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
STX4Q12846 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
STX4Q12846 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
STX4Q12846 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
STX4Q12846 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
STX4Q12846 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
STX4Q12846 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
STX4Q12846 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
STX4Q12846 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.05□□□□□ -2.4
STX4Q12846 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.05□□□□□ -2.4
STX4Q12846 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
STX4Q12846 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
STX4Q12846 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
STX4Q12846 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
STX4Q12846 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
STX4Q12846 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
STX4Q12846 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
STX4Q12846 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
STX4Q12846 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
STX4Q12846 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
STX4Q12846 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
STX4Q12846 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
STX4Q12846 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
STX4Q12846 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC0.04□□□□□ -2.4
STX4Q12846 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC0.04□□□□□ -2.4
STX4Q12846 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
STX4Q12846 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
STX4Q12846 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
STX4Q12846 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
STX4Q12846 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
STX4Q12846 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
STX4Q12846 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
STX4Q12846 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
STX4Q12846 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
STX4Q12846 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
STX4Q12846 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
STX4Q12846 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
STX4Q12846 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
STX4Q12846 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
STX4Q12846 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
STX4Q12846 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
STX4Q12846 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
STX4Q12846 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
STX4Q12846 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
STX4Q12846 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
STX4Q12846 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
STX4Q12846 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
STX4Q12846 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
STX4Q12846 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
STX4Q12846 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
STX4Q12846 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
STX4Q12846 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
STX4Q12846 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
STX4Q12846 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
STX4Q12846 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
STX4Q12846 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
STX4Q12846 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
STX4Q12846 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
STX4Q12846 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
STX4Q12846 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
STX4Q12846 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
STX4Q12846 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
STX4Q12846 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
STX4Q12846 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
STX4Q12846 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
STX4Q12846 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
STX4Q12846 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
STX4Q12846 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
STX4Q12846 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
STX4Q12846 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
STX4Q12846 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
STX4Q12846 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
STX4Q12846 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
STX4Q12846 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
STX4Q12846 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.5 ms