Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
CENPFP49454 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
CENPFP49454 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
CENPFP49454 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC-2.42□□□□□ -2.8
CENPFP49454 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
CENPFP49454 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
CENPFP49454 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC-2.42□□□□□ -2.8
CENPFP49454 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
CENPFP49454 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
CENPFP49454 MIRLET7A3-201ENST00000362116 74 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
CENPFP49454 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
CENPFP49454 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
CENPFP49454 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
CENPFP49454 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
CENPFP49454 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
CENPFP49454 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC-2.43□□□□□ -2.8
CENPFP49454 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
CENPFP49454 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
CENPFP49454 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
CENPFP49454 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
CENPFP49454 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
CENPFP49454 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-2.43□□□□□ -2.8
CENPFP49454 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
CENPFP49454 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-2.44□□□□□ -2.8
CENPFP49454 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
CENPFP49454 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
CENPFP49454 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
CENPFP49454 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
CENPFP49454 Y_RNA.520-201ENST00000384556 102 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
CENPFP49454 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
CENPFP49454 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-2.44□□□□□ -2.8
CENPFP49454 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-2.44□□□□□ -2.8
CENPFP49454 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
CENPFP49454 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
CENPFP49454 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
CENPFP49454 RNY4P25-201ENST00000459254 96 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
CENPFP49454 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
CENPFP49454 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
CENPFP49454 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
CENPFP49454 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-2.44□□□□□ -2.8
CENPFP49454 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC-2.44□□□□□ -2.8
CENPFP49454 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
CENPFP49454 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
CENPFP49454 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
CENPFP49454 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
CENPFP49454 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
CENPFP49454 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
CENPFP49454 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
CENPFP49454 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC-2.45□□□□□ -2.8
CENPFP49454 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC-2.45□□□□□ -2.8
CENPFP49454 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
CENPFP49454 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
CENPFP49454 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
CENPFP49454 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
CENPFP49454 Y_RNA.134-201ENST00000363435 105 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
CENPFP49454 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
CENPFP49454 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
CENPFP49454 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
CENPFP49454 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
CENPFP49454 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
CENPFP49454 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
CENPFP49454 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
CENPFP49454 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC-2.46□□□□□ -2.8
CENPFP49454 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
CENPFP49454 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
CENPFP49454 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
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CENPFP49454 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
CENPFP49454 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
CENPFP49454 EIF1AXP2-201ENST00000555940 413 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
CENPFP49454 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
CENPFP49454 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
CENPFP49454 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC-2.47□□□□□ -2.8
CENPFP49454 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.81
CENPFP49454 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.81
CENPFP49454 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC-2.47□□□□□ -2.81
CENPFP49454 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.81
CENPFP49454 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC-2.47□□□□□ -2.81
CENPFP49454 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
CENPFP49454 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
CENPFP49454 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
CENPFP49454 Y_RNA.266-201ENST00000364678 96 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
CENPFP49454 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
CENPFP49454 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
CENPFP49454 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
CENPFP49454 Y_RNA.79-201ENST00000362992 113 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
CENPFP49454 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
CENPFP49454 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-2.49□□□□□ -2.81
CENPFP49454 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
CENPFP49454 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
CENPFP49454 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
CENPFP49454 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC-2.49□□□□□ -2.81
CENPFP49454 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
CENPFP49454 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
CENPFP49454 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
CENPFP49454 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
CENPFP49454 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
CENPFP49454 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
CENPFP49454 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
CENPFP49454 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
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