Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPRDP23468 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPRDP23468 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPRDP23468 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPRDP23468 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPRDP23468 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPRDP23468 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPRDP23468 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPRDP23468 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPRDP23468 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPRDP23468 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPRDP23468 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPRDP23468 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
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PTPRDP23468 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PTPRDP23468 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PTPRDP23468 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PTPRDP23468 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PTPRDP23468 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PTPRDP23468 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PTPRDP23468 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PTPRDP23468 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PTPRDP23468 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PTPRDP23468 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PTPRDP23468 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PTPRDP23468 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PTPRDP23468 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PTPRDP23468 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PTPRDP23468 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PTPRDP23468 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
PTPRDP23468 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PTPRDP23468 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PTPRDP23468 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PTPRDP23468 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PTPRDP23468 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PTPRDP23468 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PTPRDP23468 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PTPRDP23468 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
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PTPRDP23468 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PTPRDP23468 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PTPRDP23468 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
PTPRDP23468 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
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PTPRDP23468 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPRDP23468 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
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