Protein–RNA interactions for Protein: O14717

TRDMT1, tRNA (cytosine(38)-C(5))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1O14717 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TRDMT1O14717 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TRDMT1O14717 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TRDMT1O14717 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TRDMT1O14717 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TRDMT1O14717 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TRDMT1O14717 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TRDMT1O14717 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TRDMT1O14717 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TRDMT1O14717 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TRDMT1O14717 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TRDMT1O14717 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC0.26□□□□□ -2.37
TRDMT1O14717 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TRDMT1O14717 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TRDMT1O14717 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TRDMT1O14717 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
TRDMT1O14717 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TRDMT1O14717 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.26□□□□□ -2.37
TRDMT1O14717 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TRDMT1O14717 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TRDMT1O14717 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TRDMT1O14717 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TRDMT1O14717 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TRDMT1O14717 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TRDMT1O14717 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TRDMT1O14717 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
TRDMT1O14717 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC0.25□□□□□ -2.37
TRDMT1O14717 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TRDMT1O14717 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TRDMT1O14717 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TRDMT1O14717 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TRDMT1O14717 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TRDMT1O14717 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TRDMT1O14717 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TRDMT1O14717 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TRDMT1O14717 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TRDMT1O14717 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
TRDMT1O14717 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TRDMT1O14717 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TRDMT1O14717 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.24□□□□□ -2.37
TRDMT1O14717 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TRDMT1O14717 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TRDMT1O14717 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TRDMT1O14717 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TRDMT1O14717 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TRDMT1O14717 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TRDMT1O14717 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TRDMT1O14717 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TRDMT1O14717 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TRDMT1O14717 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TRDMT1O14717 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
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TRDMT1O14717 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TRDMT1O14717 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
TRDMT1O14717 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TRDMT1O14717 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TRDMT1O14717 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
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TRDMT1O14717 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TRDMT1O14717 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TRDMT1O14717 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TRDMT1O14717 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
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TRDMT1O14717 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TRDMT1O14717 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
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TRDMT1O14717 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
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TRDMT1O14717 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
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TRDMT1O14717 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TRDMT1O14717 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TRDMT1O14717 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TRDMT1O14717 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TRDMT1O14717 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TRDMT1O14717 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TRDMT1O14717 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TRDMT1O14717 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TRDMT1O14717 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TRDMT1O14717 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
TRDMT1O14717 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
TRDMT1O14717 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TRDMT1O14717 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
TRDMT1O14717 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TRDMT1O14717 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TRDMT1O14717 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TRDMT1O14717 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TRDMT1O14717 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TRDMT1O14717 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TRDMT1O14717 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TRDMT1O14717 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TRDMT1O14717 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TRDMT1O14717 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TRDMT1O14717 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TRDMT1O14717 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TRDMT1O14717 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.19□□□□□ -2.38
TRDMT1O14717 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TRDMT1O14717 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TRDMT1O14717 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
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