Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

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Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.67□□□□□ -2.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.66□□□□□ -2.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.3
SHANK2-AS3Q9BTD1 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
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