Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
VAT1Q99536 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC0.16□□□□□ -2.38
VAT1Q99536 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
VAT1Q99536 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
VAT1Q99536 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.16□□□□□ -2.38
VAT1Q99536 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
VAT1Q99536 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
VAT1Q99536 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
VAT1Q99536 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
VAT1Q99536 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
VAT1Q99536 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
VAT1Q99536 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
VAT1Q99536 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
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VAT1Q99536 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
VAT1Q99536 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
VAT1Q99536 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
VAT1Q99536 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
VAT1Q99536 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
VAT1Q99536 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
VAT1Q99536 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
VAT1Q99536 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
VAT1Q99536 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
VAT1Q99536 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
VAT1Q99536 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
VAT1Q99536 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
VAT1Q99536 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
VAT1Q99536 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
VAT1Q99536 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC0.14□□□□□ -2.39
VAT1Q99536 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC0.14□□□□□ -2.39
VAT1Q99536 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
VAT1Q99536 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
VAT1Q99536 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
VAT1Q99536 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
VAT1Q99536 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
VAT1Q99536 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
VAT1Q99536 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
VAT1Q99536 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VAT1Q99536 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VAT1Q99536 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VAT1Q99536 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VAT1Q99536 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VAT1Q99536 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VAT1Q99536 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VAT1Q99536 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VAT1Q99536 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VAT1Q99536 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC0.13□□□□□ -2.39
VAT1Q99536 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
VAT1Q99536 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
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VAT1Q99536 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VAT1Q99536 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VAT1Q99536 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
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VAT1Q99536 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
VAT1Q99536 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
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VAT1Q99536 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
VAT1Q99536 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
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VAT1Q99536 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
VAT1Q99536 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
VAT1Q99536 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
VAT1Q99536 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
VAT1Q99536 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
VAT1Q99536 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
VAT1Q99536 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
VAT1Q99536 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
VAT1Q99536 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC0.1□□□□□ -2.39
VAT1Q99536 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
VAT1Q99536 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
VAT1Q99536 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
VAT1Q99536 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
VAT1Q99536 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
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