Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.67□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC0.67□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.66□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC0.66□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC0.66□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC0.63□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ZBED3Q96IU2 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
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