Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
USP53Q70EK8 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
USP53Q70EK8 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
USP53Q70EK8 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
USP53Q70EK8 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
USP53Q70EK8 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
USP53Q70EK8 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
USP53Q70EK8 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
USP53Q70EK8 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
USP53Q70EK8 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
USP53Q70EK8 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
USP53Q70EK8 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
USP53Q70EK8 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
USP53Q70EK8 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
USP53Q70EK8 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
USP53Q70EK8 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
USP53Q70EK8 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
USP53Q70EK8 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
USP53Q70EK8 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
USP53Q70EK8 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USP53Q70EK8 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USP53Q70EK8 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USP53Q70EK8 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USP53Q70EK8 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USP53Q70EK8 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USP53Q70EK8 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USP53Q70EK8 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USP53Q70EK8 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USP53Q70EK8 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USP53Q70EK8 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USP53Q70EK8 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USP53Q70EK8 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USP53Q70EK8 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USP53Q70EK8 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
USP53Q70EK8 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
USP53Q70EK8 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
USP53Q70EK8 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
USP53Q70EK8 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
USP53Q70EK8 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
USP53Q70EK8 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
USP53Q70EK8 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
USP53Q70EK8 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
USP53Q70EK8 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
USP53Q70EK8 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
USP53Q70EK8 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
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USP53Q70EK8 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
USP53Q70EK8 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
USP53Q70EK8 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
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USP53Q70EK8 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
USP53Q70EK8 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
USP53Q70EK8 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
USP53Q70EK8 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
USP53Q70EK8 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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USP53Q70EK8 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
USP53Q70EK8 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
USP53Q70EK8 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
USP53Q70EK8 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
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USP53Q70EK8 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
USP53Q70EK8 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
USP53Q70EK8 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
USP53Q70EK8 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
USP53Q70EK8 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
USP53Q70EK8 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
USP53Q70EK8 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
USP53Q70EK8 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
USP53Q70EK8 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
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