Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
C9orf135Q5VTT2 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
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