Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC-0.65□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
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RTL8BQ17RB0 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
RTL8BQ17RB0 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
RTL8BQ17RB0 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
RTL8BQ17RB0 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
RTL8BQ17RB0 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
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RTL8BQ17RB0 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC-0.66□□□□□ -2.52
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RTL8BQ17RB0 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
RTL8BQ17RB0 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
RTL8BQ17RB0 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
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RTL8BQ17RB0 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
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RTL8BQ17RB0 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
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RTL8BQ17RB0 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
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RTL8BQ17RB0 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
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RTL8BQ17RB0 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
RTL8BQ17RB0 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
RTL8BQ17RB0 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
RTL8BQ17RB0 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
RTL8BQ17RB0 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.69□□□□□ -2.52
RTL8BQ17RB0 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
RTL8BQ17RB0 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
RTL8BQ17RB0 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
RTL8BQ17RB0 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
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RTL8BQ17RB0 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
RTL8BQ17RB0 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
RTL8BQ17RB0 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
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