Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CLPPQ16740 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.04□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
CLPPQ16740 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
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