Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

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Length 942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
PKN1Q16512 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PKN1Q16512 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
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