Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SNCBQ16143 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
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SNCBQ16143 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
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SNCBQ16143 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
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SNCBQ16143 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC-0.62□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
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SNCBQ16143 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
SNCBQ16143 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
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