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Protein–RNA interactions for Protein: Q16143
SNCB, Beta-synuclein, human
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
SNCB
Q16143
AC022166.2-201
ENST00000566030
536 nt
TSL 4
BASIC
-0.58
□□□□□ -2.5
SNCB
Q16143
AC015845.1-201
ENST00000579285
335 nt
TSL 3
BASIC
-0.58
□□□□□ -2.5
SNCB
Q16143
MIR548AD-201
ENST00000584780
82 nt
BASIC
-0.58
□□□□□ -2.5
SNCB
Q16143
AC103705.1-201
ENST00000619013
241 nt
BASIC
-0.58
□□□□□ -2.5
SNCB
Q16143
AC010332.2-201
ENST00000613083
1904 nt
BASIC
-0.58
□□□□□ -2.5
SNCB
Q16143
snoU2-30.1-201
ENST00000365012
70 nt
BASIC
-0.59
□□□□□ -2.5
SNCB
Q16143
RNU6-282P-201
ENST00000365357
103 nt
BASIC
-0.59
□□□□□ -2.5
SNCB
Q16143
RNU6-1264P-201
ENST00000383891
107 nt
BASIC
-0.59
□□□□□ -2.5
SNCB
Q16143
RNU6-364P-201
ENST00000384387
107 nt
BASIC
-0.59
□□□□□ -2.5
SNCB
Q16143
RNU6-456P-201
ENST00000384493
107 nt
BASIC
-0.59
□□□□□ -2.5
SNCB
Q16143
Y_RNA.537-201
ENST00000384626
109 nt
BASIC
-0.59
□□□□□ -2.5
SNCB
Q16143
MTCO2P33-201
ENST00000402100
465 nt
BASIC
-0.59
□□□□□ -2.5
SNCB
Q16143
AL590002.1-201
ENST00000406554
418 nt
BASIC
-0.59
□□□□□ -2.5
SNCB
Q16143
AL354751.2-201
ENST00000415471
210 nt
BASIC
-0.59
□□□□□ -2.5
SNCB
Q16143
AL008987.1-201
ENST00000415528
237 nt
BASIC
-0.59
□□□□□ -2.5
SNCB
Q16143
ZNF736P8Y-201
ENST00000451913
669 nt
BASIC
-0.59
□□□□□ -2.5
SNCB
Q16143
RNU7-62P-201
ENST00000458856
62 nt
BASIC
-0.59
□□□□□ -2.5
SNCB
Q16143
AC026782.1-201
ENST00000512952
449 nt
BASIC
-0.59
□□□□□ -2.5
SNCB
Q16143
AC046134.1-201
ENST00000514454
666 nt
BASIC
-0.59
□□□□□ -2.5
SNCB
Q16143
MTND4P7-201
ENST00000523876
130 nt
BASIC
-0.59
□□□□□ -2.5
SNCB
Q16143
MIR4424-201
ENST00000585257
86 nt
BASIC
-0.59
□□□□□ -2.5
SNCB
Q16143
AL133215.3-201
ENST00000609801
448 nt
BASIC
-0.59
□□□□□ -2.5
SNCB
Q16143
AC087683.2-201
ENST00000611384
326 nt
BASIC
-0.59
□□□□□ -2.5
SNCB
Q16143
DLX6-AS1_2.1-201
ENST00000613701
207 nt
BASIC
-0.59
□□□□□ -2.5
SNCB
Q16143
MIR8066-201
ENST00000617280
78 nt
BASIC
-0.59
□□□□□ -2.5
SNCB
Q16143
FTX_2.1-201
ENST00000618816
94 nt
BASIC
-0.59
□□□□□ -2.5
SNCB
Q16143
uc_338.36-201
ENST00000622331
158 nt
BASIC
-0.59
□□□□□ -2.5
SNCB
Q16143
Y_RNA.32-201
ENST00000362589
110 nt
BASIC
-0.6
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
Y_RNA.42-201
ENST00000362660
108 nt
BASIC
-0.6
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
SNORA32.3-201
ENST00000384772
121 nt
BASIC
-0.6
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
AL121872.1-201
ENST00000420327
281 nt
TSL 5
BASIC
-0.6
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
AC092447.3-201
ENST00000426027
686 nt
BASIC
-0.6
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
SNRPGP14-201
ENST00000435400
219 nt
BASIC
-0.6
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
MIR18B-201
ENST00000454574
71 nt
BASIC
-0.6
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
AC010486.3-201
ENST00000511602
785 nt
BASIC
-0.6
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
RNU6-189P-201
ENST00000516120
101 nt
BASIC
-0.6
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
RNU6-107P-201
ENST00000516643
102 nt
BASIC
-0.6
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
AC121247.2-201
ENST00000604776
136 nt
BASIC
-0.6
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
MIR4791-201
ENST00000607666
84 nt
BASIC
-0.6
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
MIR8064-201
ENST00000612863
90 nt
BASIC
-0.6
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
AP001506.1-201
ENST00000615444
211 nt
BASIC
-0.6
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
CLRN1-AS1.1-201
ENST00000615643
79 nt
BASIC
-0.6
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
uc_338.4-201
ENST00000616635
176 nt
BASIC
-0.6
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
SNORD114-11-201
ENST00000363738
75 nt
BASIC
-0.61
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
RNU6-82P-201
ENST00000363970
107 nt
BASIC
-0.61
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
Y_RNA.253-201
ENST00000364562
112 nt
BASIC
-0.61
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
Y_RNA.368-201
ENST00000365547
113 nt
BASIC
-0.61
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
Y_RNA.412-201
ENST00000384001
104 nt
BASIC
-0.61
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
RNU6-541P-201
ENST00000384709
110 nt
BASIC
-0.61
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
RNU6-284P-201
ENST00000411105
106 nt
BASIC
-0.61
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
ELOCP21-201
ENST00000412558
336 nt
BASIC
-0.61
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
AL358934.1-201
ENST00000432346
324 nt
BASIC
-0.61
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
MTATP6P14-201
ENST00000455189
673 nt
BASIC
-0.61
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
AC137770.1-201
ENST00000504620
530 nt
TSL 3
BASIC
-0.61
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
Y_RNA.683-201
ENST00000516508
93 nt
BASIC
-0.61
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
MIR4645-201
ENST00000583158
77 nt
BASIC
-0.61
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
AL590491.3-201
ENST00000610731
82 nt
BASIC
-0.61
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
SOX2OT_exon1.1-201
ENST00000614902
232 nt
BASIC
-0.61
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
MIR548AZ-201
ENST00000616567
95 nt
BASIC
-0.61
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
U6.115-201
ENST00000636045
103 nt
BASIC
-0.61
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
RNU6-1084P-201
ENST00000362498
107 nt
BASIC
-0.62
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
SNORD114-31-201
ENST00000363219
75 nt
BASIC
-0.62
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
SNORD49B-201
ENST00000365172
72 nt
BASIC
-0.62
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
RNU6-652P-201
ENST00000365488
107 nt
BASIC
-0.62
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
SNORA51.10-201
ENST00000384418
136 nt
BASIC
-0.62
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
RNU6-933P-201
ENST00000384424
107 nt
BASIC
-0.62
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
TRAJ34-201
ENST00000390503
58 nt
APPRIS P1
BASIC
-0.62
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
AC004543.1-201
ENST00000418764
369 nt
TSL 5
BASIC
-0.62
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
POLR2KP2-201
ENST00000438155
177 nt
BASIC
-0.62
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
LINC01813-201
ENST00000451034
712 nt
TSL 1 (best)
BASIC
-0.62
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
AC055733.2-201
ENST00000504737
340 nt
TSL 2
BASIC
-0.62
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
RNU6-830P-201
ENST00000516353
107 nt
BASIC
-0.62
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
SNORA31.14-201
ENST00000516728
116 nt
BASIC
-0.62
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
MIR5692C1-201
ENST00000585309
91 nt
BASIC
-0.62
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
SNORA70.25-201
ENST00000612741
95 nt
BASIC
-0.62
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
FAM157A-202
ENST00000615155
405 nt
BASIC
-0.62
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
AC240442.1-201
ENST00000616055
283 nt
BASIC
-0.62
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
TUG1_4.1-201
ENST00000619464
181 nt
BASIC
-0.62
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
AL391099.1-201
ENST00000624635
187 nt
BASIC
-0.62
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
MIR4788-201
ENST00000639104
80 nt
BASIC
-0.62
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
AC091304.10-201
ENST00000641554
121 nt
BASIC
-0.62
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
AP003174.1-201
ENST00000306533
376 nt
TSL 2
BASIC
-0.63
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
MIR410-201
ENST00000362222
80 nt
BASIC
-0.63
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
RNU6-181P-201
ENST00000363225
107 nt
BASIC
-0.63
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
SNORA63C-201
ENST00000364578
129 nt
BASIC
-0.63
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
RNU6-740P-201
ENST00000364734
105 nt
BASIC
-0.63
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
Y_RNA.466-201
ENST00000384294
113 nt
BASIC
-0.63
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
SNORD28-201
ENST00000384706
75 nt
BASIC
-0.63
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
RNY3P9-201
ENST00000384727
106 nt
BASIC
-0.63
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
MIR122-201
ENST00000385044
85 nt
BASIC
-0.63
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
AC073464.1-201
ENST00000429823
534 nt
BASIC
-0.63
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
MTCO2P16-201
ENST00000436962
677 nt
BASIC
-0.63
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
RNU7-73P-201
ENST00000458743
63 nt
BASIC
-0.63
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
RNA5SP285-201
ENST00000516619
119 nt
BASIC
-0.63
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
RNU6-445P-201
ENST00000516949
107 nt
BASIC
-0.63
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
NDUFV2-AS1-202
ENST00000583081
399 nt
TSL 5
BASIC
-0.63
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
AL442067.1-201
ENST00000613261
223 nt
BASIC
-0.63
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
AC134878.1-201
ENST00000619901
243 nt
BASIC
-0.63
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
OSBPL1A-217
ENST00000638614
84 nt
TSL 5
BASIC
-0.63
□□□□□ -2.51
SNCB
Q16143
RNU6-1115P-201
ENST00000362490
106 nt
BASIC
-0.64
□□□□□ -2.51
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