Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

Predictions only

Length 2,313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CACNA1EQ15878 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
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