Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC0.16□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.16□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC0.16□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC0.16□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC0.16□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
SCN9AQ15858 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.15□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SCN9AQ15858 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
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