Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
USF2Q15853 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
USF2Q15853 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
USF2Q15853 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
USF2Q15853 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
USF2Q15853 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
USF2Q15853 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
USF2Q15853 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
USF2Q15853 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
USF2Q15853 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
USF2Q15853 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
USF2Q15853 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC0.01□□□□□ -2.41
USF2Q15853 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
USF2Q15853 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
USF2Q15853 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
USF2Q15853 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
USF2Q15853 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
USF2Q15853 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
USF2Q15853 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC0□□□□□ -2.41
USF2Q15853 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC0□□□□□ -2.41
USF2Q15853 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC0□□□□□ -2.41
USF2Q15853 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC0□□□□□ -2.41
USF2Q15853 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
USF2Q15853 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
USF2Q15853 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC0□□□□□ -2.41
USF2Q15853 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0□□□□□ -2.41
USF2Q15853 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC0□□□□□ -2.41
USF2Q15853 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
USF2Q15853 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC0□□□□□ -2.41
USF2Q15853 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC0□□□□□ -2.41
USF2Q15853 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC0□□□□□ -2.41
USF2Q15853 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC0□□□□□ -2.41
USF2Q15853 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC0□□□□□ -2.41
USF2Q15853 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0□□□□□ -2.41
USF2Q15853 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC0□□□□□ -2.41
USF2Q15853 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0□□□□□ -2.41
USF2Q15853 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC0□□□□□ -2.41
USF2Q15853 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC0□□□□□ -2.41
USF2Q15853 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC0□□□□□ -2.41
USF2Q15853 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC0□□□□□ -2.41
USF2Q15853 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC0□□□□□ -2.41
USF2Q15853 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC0□□□□□ -2.41
USF2Q15853 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC0□□□□□ -2.41
USF2Q15853 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC0□□□□□ -2.41
USF2Q15853 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
USF2Q15853 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
USF2Q15853 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
USF2Q15853 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
USF2Q15853 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
USF2Q15853 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
USF2Q15853 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
USF2Q15853 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
USF2Q15853 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
USF2Q15853 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
USF2Q15853 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
USF2Q15853 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
USF2Q15853 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
USF2Q15853 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
USF2Q15853 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
USF2Q15853 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
USF2Q15853 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
USF2Q15853 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
USF2Q15853 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
USF2Q15853 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
USF2Q15853 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
USF2Q15853 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
USF2Q15853 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
USF2Q15853 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
USF2Q15853 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
USF2Q15853 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
USF2Q15853 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
USF2Q15853 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
USF2Q15853 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
USF2Q15853 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
USF2Q15853 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
USF2Q15853 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
USF2Q15853 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
USF2Q15853 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
USF2Q15853 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
USF2Q15853 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
USF2Q15853 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
USF2Q15853 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
USF2Q15853 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
USF2Q15853 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
USF2Q15853 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
USF2Q15853 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
USF2Q15853 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
USF2Q15853 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
USF2Q15853 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
USF2Q15853 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
USF2Q15853 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
USF2Q15853 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
USF2Q15853 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
USF2Q15853 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
USF2Q15853 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
USF2Q15853 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
USF2Q15853 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
USF2Q15853 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
USF2Q15853 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
USF2Q15853 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
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