Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 Y_RNA.658-201ENST00000515990 97 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 RNY4P10-201ENST00000365571 96 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
HERC1Q15751 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.1 ms