Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
ALX1Q15699 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ALX1Q15699 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ALX1Q15699 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ALX1Q15699 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ALX1Q15699 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ALX1Q15699 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ALX1Q15699 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC-0.96□□□□□ -2.56
ALX1Q15699 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ALX1Q15699 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ALX1Q15699 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ALX1Q15699 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ALX1Q15699 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ALX1Q15699 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ALX1Q15699 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ALX1Q15699 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
ALX1Q15699 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC-0.97□□□□□ -2.56
ALX1Q15699 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ALX1Q15699 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ALX1Q15699 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ALX1Q15699 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ALX1Q15699 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC-0.97□□□□□ -2.56
ALX1Q15699 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC-0.97□□□□□ -2.56
ALX1Q15699 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ALX1Q15699 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ALX1Q15699 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC-0.97□□□□□ -2.56
ALX1Q15699 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ALX1Q15699 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC-0.97□□□□□ -2.56
ALX1Q15699 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ALX1Q15699 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
ALX1Q15699 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ALX1Q15699 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ALX1Q15699 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ALX1Q15699 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ALX1Q15699 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ALX1Q15699 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ALX1Q15699 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ALX1Q15699 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ALX1Q15699 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC-0.98□□□□□ -2.57
ALX1Q15699 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ALX1Q15699 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ALX1Q15699 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ALX1Q15699 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ALX1Q15699 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ALX1Q15699 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ALX1Q15699 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
ALX1Q15699 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC-0.98□□□□□ -2.57
ALX1Q15699 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ALX1Q15699 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ALX1Q15699 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ALX1Q15699 AC036101.1-201ENST00000449272 597 ntTSL 3 BASIC-0.99□□□□□ -2.57
ALX1Q15699 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC-0.99□□□□□ -2.57
ALX1Q15699 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC-0.99□□□□□ -2.57
ALX1Q15699 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ALX1Q15699 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ALX1Q15699 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC-0.99□□□□□ -2.57
ALX1Q15699 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ALX1Q15699 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
ALX1Q15699 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ALX1Q15699 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ALX1Q15699 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ALX1Q15699 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ALX1Q15699 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ALX1Q15699 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ALX1Q15699 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ALX1Q15699 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC-1□□□□□ -2.57
ALX1Q15699 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC-1□□□□□ -2.57
ALX1Q15699 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ALX1Q15699 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC-1□□□□□ -2.57
ALX1Q15699 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ALX1Q15699 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ALX1Q15699 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ALX1Q15699 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ALX1Q15699 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC-1□□□□□ -2.57
ALX1Q15699 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ALX1Q15699 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ALX1Q15699 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ALX1Q15699 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
ALX1Q15699 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ALX1Q15699 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ALX1Q15699 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ALX1Q15699 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ALX1Q15699 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC-1.01□□□□□ -2.57
ALX1Q15699 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ALX1Q15699 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ALX1Q15699 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ALX1Q15699 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ALX1Q15699 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ALX1Q15699 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ALX1Q15699 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ALX1Q15699 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
ALX1Q15699 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ALX1Q15699 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ALX1Q15699 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ALX1Q15699 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.02□□□□□ -2.57
ALX1Q15699 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ALX1Q15699 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ALX1Q15699 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ALX1Q15699 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ALX1Q15699 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
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