Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ZNHIT3Q15649 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ZNHIT3Q15649 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ZNHIT3Q15649 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ZNHIT3Q15649 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ZNHIT3Q15649 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ZNHIT3Q15649 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ZNHIT3Q15649 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ZNHIT3Q15649 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms