Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SS18Q15532 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SS18Q15532 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SS18Q15532 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
SS18Q15532 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SS18Q15532 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SS18Q15532 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SS18Q15532 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SS18Q15532 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SS18Q15532 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SS18Q15532 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SS18Q15532 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SS18Q15532 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SS18Q15532 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SS18Q15532 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SS18Q15532 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC0.4□□□□□ -2.35
SS18Q15532 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
SS18Q15532 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SS18Q15532 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SS18Q15532 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SS18Q15532 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SS18Q15532 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SS18Q15532 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SS18Q15532 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SS18Q15532 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SS18Q15532 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SS18Q15532 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
SS18Q15532 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SS18Q15532 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SS18Q15532 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SS18Q15532 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SS18Q15532 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SS18Q15532 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SS18Q15532 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SS18Q15532 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SS18Q15532 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SS18Q15532 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SS18Q15532 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SS18Q15532 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SS18Q15532 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SS18Q15532 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SS18Q15532 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SS18Q15532 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SS18Q15532 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SS18Q15532 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
SS18Q15532 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SS18Q15532 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SS18Q15532 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SS18Q15532 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SS18Q15532 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SS18Q15532 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
SS18Q15532 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
SS18Q15532 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
SS18Q15532 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SS18Q15532 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SS18Q15532 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC0.39□□□□□ -2.35
SS18Q15532 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SS18Q15532 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SS18Q15532 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SS18Q15532 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SS18Q15532 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SS18Q15532 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SS18Q15532 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SS18Q15532 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SS18Q15532 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SS18Q15532 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SS18Q15532 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SS18Q15532 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SS18Q15532 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SS18Q15532 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SS18Q15532 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SS18Q15532 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SS18Q15532 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SS18Q15532 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SS18Q15532 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SS18Q15532 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SS18Q15532 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
SS18Q15532 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SS18Q15532 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SS18Q15532 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SS18Q15532 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SS18Q15532 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SS18Q15532 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SS18Q15532 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SS18Q15532 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SS18Q15532 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SS18Q15532 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SS18Q15532 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SS18Q15532 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SS18Q15532 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SS18Q15532 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SS18Q15532 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SS18Q15532 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
SS18Q15532 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.37□□□□□ -2.35
SS18Q15532 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SS18Q15532 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SS18Q15532 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SS18Q15532 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SS18Q15532 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SS18Q15532 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.4 ms