Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
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PTPRKQ15262 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
PTPRKQ15262 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
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PTPRKQ15262 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
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PTPRKQ15262 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
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PTPRKQ15262 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.36□□□□□ -2.35
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PTPRKQ15262 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
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PTPRKQ15262 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRKQ15262 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
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PTPRKQ15262 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRKQ15262 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRKQ15262 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRKQ15262 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.31□□□□□ -2.36
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