Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.12□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.12□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
HERPUD1Q15011 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
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