Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CHD4Q14839 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CHD4Q14839 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
CHD4Q14839 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHD4Q14839 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHD4Q14839 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHD4Q14839 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHD4Q14839 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHD4Q14839 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHD4Q14839 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHD4Q14839 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
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CHD4Q14839 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
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CHD4Q14839 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHD4Q14839 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHD4Q14839 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHD4Q14839 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHD4Q14839 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
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CHD4Q14839 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
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CHD4Q14839 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHD4Q14839 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHD4Q14839 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CHD4Q14839 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHD4Q14839 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHD4Q14839 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHD4Q14839 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CHD4Q14839 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
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CHD4Q14839 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CHD4Q14839 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CHD4Q14839 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CHD4Q14839 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CHD4Q14839 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CHD4Q14839 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CHD4Q14839 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CHD4Q14839 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CHD4Q14839 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
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CHD4Q14839 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
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CHD4Q14839 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
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CHD4Q14839 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHD4Q14839 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC1.22□□□□□ -2.21
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CHD4Q14839 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHD4Q14839 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHD4Q14839 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CHD4Q14839 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CHD4Q14839 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
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