Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC-1.18□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC-1.18□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC-1.2□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-1.2□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC-1.2□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC-1.22□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC-1.22□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC-1.22□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SMCO1Q147U7 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-1.23□□□□□ -2.61
SMCO1Q147U7 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SMCO1Q147U7 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SMCO1Q147U7 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SMCO1Q147U7 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SMCO1Q147U7 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SMCO1Q147U7 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SMCO1Q147U7 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SMCO1Q147U7 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SMCO1Q147U7 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SMCO1Q147U7 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SMCO1Q147U7 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC-1.23□□□□□ -2.61
SMCO1Q147U7 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SMCO1Q147U7 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SMCO1Q147U7 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SMCO1Q147U7 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SMCO1Q147U7 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SMCO1Q147U7 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SMCO1Q147U7 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SMCO1Q147U7 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SMCO1Q147U7 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SMCO1Q147U7 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SMCO1Q147U7 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SMCO1Q147U7 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SMCO1Q147U7 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SMCO1Q147U7 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC-1.25□□□□□ -2.61
SMCO1Q147U7 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SMCO1Q147U7 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SMCO1Q147U7 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC-1.25□□□□□ -2.61
SMCO1Q147U7 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SMCO1Q147U7 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SMCO1Q147U7 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SMCO1Q147U7 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC-1.25□□□□□ -2.61
SMCO1Q147U7 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SMCO1Q147U7 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SMCO1Q147U7 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SMCO1Q147U7 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SMCO1Q147U7 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SMCO1Q147U7 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
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