Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RBM39Q14498 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
RBM39Q14498 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 205.2 ms