Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.19□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.21□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PDE6HQ13956 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.6 ms