Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
APOFQ13790 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
APOFQ13790 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
APOFQ13790 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
APOFQ13790 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
APOFQ13790 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
APOFQ13790 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
APOFQ13790 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
APOFQ13790 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
APOFQ13790 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
APOFQ13790 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
APOFQ13790 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
APOFQ13790 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
APOFQ13790 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
APOFQ13790 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
APOFQ13790 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.24□□□□□ -2.37
APOFQ13790 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
APOFQ13790 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
APOFQ13790 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC0.24□□□□□ -2.37
APOFQ13790 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.23□□□□□ -2.37
APOFQ13790 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.23□□□□□ -2.37
APOFQ13790 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
APOFQ13790 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
APOFQ13790 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
APOFQ13790 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
APOFQ13790 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
APOFQ13790 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
APOFQ13790 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
APOFQ13790 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
APOFQ13790 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
APOFQ13790 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
APOFQ13790 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
APOFQ13790 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
APOFQ13790 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
APOFQ13790 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
APOFQ13790 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
APOFQ13790 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
APOFQ13790 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
APOFQ13790 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
APOFQ13790 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
APOFQ13790 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
APOFQ13790 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
APOFQ13790 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
APOFQ13790 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
APOFQ13790 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
APOFQ13790 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
APOFQ13790 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
APOFQ13790 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC0.22□□□□□ -2.37
APOFQ13790 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
APOFQ13790 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
APOFQ13790 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC0.22□□□□□ -2.37
APOFQ13790 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
APOFQ13790 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
APOFQ13790 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
APOFQ13790 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC0.22□□□□□ -2.37
APOFQ13790 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC0.22□□□□□ -2.37
APOFQ13790 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC0.22□□□□□ -2.37
APOFQ13790 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
APOFQ13790 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
APOFQ13790 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
APOFQ13790 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
APOFQ13790 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
APOFQ13790 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
APOFQ13790 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
APOFQ13790 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
APOFQ13790 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
APOFQ13790 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
APOFQ13790 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
APOFQ13790 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
APOFQ13790 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC0.21□□□□□ -2.38
APOFQ13790 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
APOFQ13790 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
APOFQ13790 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
APOFQ13790 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
APOFQ13790 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
APOFQ13790 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
APOFQ13790 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
APOFQ13790 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
APOFQ13790 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
APOFQ13790 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
APOFQ13790 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
APOFQ13790 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC0.2□□□□□ -2.38
APOFQ13790 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
APOFQ13790 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
APOFQ13790 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
APOFQ13790 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
APOFQ13790 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
APOFQ13790 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
APOFQ13790 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.2□□□□□ -2.38
APOFQ13790 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
APOFQ13790 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
APOFQ13790 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
APOFQ13790 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
APOFQ13790 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
APOFQ13790 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
APOFQ13790 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
APOFQ13790 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
APOFQ13790 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
APOFQ13790 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
APOFQ13790 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.9 ms