Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
IRF5Q13568 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
IRF5Q13568 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
IRF5Q13568 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
IRF5Q13568 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
IRF5Q13568 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
IRF5Q13568 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
IRF5Q13568 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
IRF5Q13568 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
IRF5Q13568 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
IRF5Q13568 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
IRF5Q13568 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.5 ms