Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ATRQ13535 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ATRQ13535 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ATRQ13535 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ATRQ13535 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ATRQ13535 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ATRQ13535 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ATRQ13535 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
ATRQ13535 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ATRQ13535 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ATRQ13535 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ATRQ13535 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ATRQ13535 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ATRQ13535 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
ATRQ13535 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ATRQ13535 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ATRQ13535 RNU6-803P-201ENST00000516034 102 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ATRQ13535 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ATRQ13535 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
ATRQ13535 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
ATRQ13535 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ATRQ13535 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ATRQ13535 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC-0.65□□□□□ -2.51
ATRQ13535 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ATRQ13535 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
ATRQ13535 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
ATRQ13535 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
ATRQ13535 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
ATRQ13535 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
ATRQ13535 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC-0.66□□□□□ -2.51
ATRQ13535 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC-0.66□□□□□ -2.51
ATRQ13535 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
ATRQ13535 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
ATRQ13535 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
ATRQ13535 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC-0.66□□□□□ -2.52
ATRQ13535 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC-0.66□□□□□ -2.52
ATRQ13535 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
ATRQ13535 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
ATRQ13535 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
ATRQ13535 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
ATRQ13535 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
ATRQ13535 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
ATRQ13535 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
ATRQ13535 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
ATRQ13535 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
ATRQ13535 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
ATRQ13535 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
ATRQ13535 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
ATRQ13535 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
ATRQ13535 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
ATRQ13535 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC-0.67□□□□□ -2.52
ATRQ13535 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
ATRQ13535 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
ATRQ13535 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
ATRQ13535 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
ATRQ13535 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
ATRQ13535 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
ATRQ13535 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
ATRQ13535 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
ATRQ13535 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
ATRQ13535 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ATRQ13535 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ATRQ13535 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ATRQ13535 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
ATRQ13535 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ATRQ13535 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ATRQ13535 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ATRQ13535 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ATRQ13535 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ATRQ13535 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ATRQ13535 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ATRQ13535 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ATRQ13535 AC036101.1-201ENST00000449272 597 ntTSL 3 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
ATRQ13535 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
ATRQ13535 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ATRQ13535 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ATRQ13535 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-0.68□□□□□ -2.52
ATRQ13535 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
ATRQ13535 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ATRQ13535 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ATRQ13535 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ATRQ13535 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ATRQ13535 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ATRQ13535 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ATRQ13535 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ATRQ13535 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ATRQ13535 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ATRQ13535 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
ATRQ13535 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ATRQ13535 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ATRQ13535 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ATRQ13535 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ATRQ13535 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ATRQ13535 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ATRQ13535 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ATRQ13535 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ATRQ13535 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
ATRQ13535 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
ATRQ13535 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
ATRQ13535 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
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