Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PRPF4BQ13523 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PRPF4BQ13523 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PRPF4BQ13523 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PRPF4BQ13523 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PRPF4BQ13523 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PRPF4BQ13523 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PRPF4BQ13523 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PRPF4BQ13523 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PRPF4BQ13523 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PRPF4BQ13523 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PRPF4BQ13523 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PRPF4BQ13523 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PRPF4BQ13523 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PRPF4BQ13523 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PRPF4BQ13523 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
PRPF4BQ13523 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PRPF4BQ13523 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PRPF4BQ13523 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PRPF4BQ13523 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PRPF4BQ13523 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PRPF4BQ13523 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PRPF4BQ13523 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PRPF4BQ13523 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PRPF4BQ13523 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PRPF4BQ13523 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PRPF4BQ13523 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PRPF4BQ13523 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PRPF4BQ13523 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PRPF4BQ13523 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PRPF4BQ13523 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PRPF4BQ13523 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PRPF4BQ13523 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PRPF4BQ13523 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
PRPF4BQ13523 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PRPF4BQ13523 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PRPF4BQ13523 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PRPF4BQ13523 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PRPF4BQ13523 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PRPF4BQ13523 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PRPF4BQ13523 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PRPF4BQ13523 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PRPF4BQ13523 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
PRPF4BQ13523 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PRPF4BQ13523 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PRPF4BQ13523 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PRPF4BQ13523 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PRPF4BQ13523 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PRPF4BQ13523 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PRPF4BQ13523 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PRPF4BQ13523 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PRPF4BQ13523 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PRPF4BQ13523 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PRPF4BQ13523 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PRPF4BQ13523 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PRPF4BQ13523 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PRPF4BQ13523 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
PRPF4BQ13523 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
PRPF4BQ13523 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PRPF4BQ13523 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PRPF4BQ13523 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PRPF4BQ13523 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PRPF4BQ13523 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PRPF4BQ13523 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PRPF4BQ13523 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PRPF4BQ13523 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PRPF4BQ13523 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PRPF4BQ13523 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PRPF4BQ13523 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PRPF4BQ13523 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PRPF4BQ13523 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PRPF4BQ13523 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PRPF4BQ13523 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PRPF4BQ13523 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PRPF4BQ13523 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PRPF4BQ13523 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PRPF4BQ13523 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PRPF4BQ13523 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
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