Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
TUBB3Q13509 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TUBB3Q13509 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TUBB3Q13509 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TUBB3Q13509 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TUBB3Q13509 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TUBB3Q13509 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TUBB3Q13509 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TUBB3Q13509 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TUBB3Q13509 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TUBB3Q13509 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TUBB3Q13509 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TUBB3Q13509 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
TUBB3Q13509 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TUBB3Q13509 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TUBB3Q13509 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TUBB3Q13509 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
TUBB3Q13509 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TUBB3Q13509 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TUBB3Q13509 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
TUBB3Q13509 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TUBB3Q13509 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TUBB3Q13509 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TUBB3Q13509 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TUBB3Q13509 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TUBB3Q13509 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TUBB3Q13509 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TUBB3Q13509 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
TUBB3Q13509 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TUBB3Q13509 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
TUBB3Q13509 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
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TUBB3Q13509 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TUBB3Q13509 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TUBB3Q13509 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TUBB3Q13509 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TUBB3Q13509 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TUBB3Q13509 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TUBB3Q13509 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TUBB3Q13509 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TUBB3Q13509 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
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TUBB3Q13509 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TUBB3Q13509 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
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TUBB3Q13509 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TUBB3Q13509 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
TUBB3Q13509 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
TUBB3Q13509 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TUBB3Q13509 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
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TUBB3Q13509 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
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TUBB3Q13509 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TUBB3Q13509 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
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TUBB3Q13509 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TUBB3Q13509 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
TUBB3Q13509 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
TUBB3Q13509 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
TUBB3Q13509 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TUBB3Q13509 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TUBB3Q13509 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TUBB3Q13509 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TUBB3Q13509 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TUBB3Q13509 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TUBB3Q13509 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TUBB3Q13509 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
TUBB3Q13509 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
TUBB3Q13509 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TUBB3Q13509 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TUBB3Q13509 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
TUBB3Q13509 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TUBB3Q13509 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
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