Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC2.47□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC2.46□□□□□ -2.01
TOP3AQ13472 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
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