Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
MKRN4PQ13434 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 196.5 ms