Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRIM28Q13263 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRIM28Q13263 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
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