Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SRSF6Q13247 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC-0.03□□□□□ -2.42
SRSF6Q13247 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SRSF6Q13247 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SRSF6Q13247 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SRSF6Q13247 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SRSF6Q13247 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SRSF6Q13247 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SRSF6Q13247 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SRSF6Q13247 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SRSF6Q13247 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SRSF6Q13247 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.3 ms