Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.26
RPA4Q13156 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC0.89□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RPA4Q13156 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
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