Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CHAF1BQ13112 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
CHAF1BQ13112 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CHAF1BQ13112 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CHAF1BQ13112 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CHAF1BQ13112 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CHAF1BQ13112 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CHAF1BQ13112 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CHAF1BQ13112 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CHAF1BQ13112 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CHAF1BQ13112 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
CHAF1BQ13112 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CHAF1BQ13112 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
CHAF1BQ13112 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
CHAF1BQ13112 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CHAF1BQ13112 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CHAF1BQ13112 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CHAF1BQ13112 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CHAF1BQ13112 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
CHAF1BQ13112 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CHAF1BQ13112 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CHAF1BQ13112 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CHAF1BQ13112 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CHAF1BQ13112 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CHAF1BQ13112 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CHAF1BQ13112 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CHAF1BQ13112 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CHAF1BQ13112 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
CHAF1BQ13112 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CHAF1BQ13112 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
CHAF1BQ13112 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CHAF1BQ13112 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC1.36□□□□□ -2.19
CHAF1BQ13112 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
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