Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GPS1Q13098 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GPS1Q13098 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GPS1Q13098 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GPS1Q13098 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GPS1Q13098 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GPS1Q13098 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
GPS1Q13098 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GPS1Q13098 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
GPS1Q13098 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GPS1Q13098 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
GPS1Q13098 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GPS1Q13098 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GPS1Q13098 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GPS1Q13098 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GPS1Q13098 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GPS1Q13098 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GPS1Q13098 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GPS1Q13098 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GPS1Q13098 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GPS1Q13098 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GPS1Q13098 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GPS1Q13098 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
GPS1Q13098 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
GPS1Q13098 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GPS1Q13098 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GPS1Q13098 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
GPS1Q13098 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
GPS1Q13098 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GPS1Q13098 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
GPS1Q13098 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GPS1Q13098 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GPS1Q13098 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GPS1Q13098 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GPS1Q13098 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GPS1Q13098 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GPS1Q13098 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.08
GPS1Q13098 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GPS1Q13098 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GPS1Q13098 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GPS1Q13098 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
GPS1Q13098 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GPS1Q13098 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GPS1Q13098 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GPS1Q13098 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GPS1Q13098 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GPS1Q13098 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GPS1Q13098 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GPS1Q13098 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
GPS1Q13098 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
GPS1Q13098 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC2□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GPS1Q13098 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
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