Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
MRPL28Q13084 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.57□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.57□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC0.55□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.53□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
MRPL28Q13084 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
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