Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
STRN3Q13033 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
STRN3Q13033 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
STRN3Q13033 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
STRN3Q13033 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
STRN3Q13033 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
STRN3Q13033 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
STRN3Q13033 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
STRN3Q13033 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
STRN3Q13033 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
STRN3Q13033 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
STRN3Q13033 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
STRN3Q13033 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
STRN3Q13033 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
STRN3Q13033 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
STRN3Q13033 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
STRN3Q13033 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
STRN3Q13033 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
STRN3Q13033 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
STRN3Q13033 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
STRN3Q13033 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
STRN3Q13033 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 233.1 ms