Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
BNIP1Q12981 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
BNIP1Q12981 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
BNIP1Q12981 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
BNIP1Q12981 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
BNIP1Q12981 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
BNIP1Q12981 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
BNIP1Q12981 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
BNIP1Q12981 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
BNIP1Q12981 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
BNIP1Q12981 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
BNIP1Q12981 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
BNIP1Q12981 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
BNIP1Q12981 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
BNIP1Q12981 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
BNIP1Q12981 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
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BNIP1Q12981 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
BNIP1Q12981 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
BNIP1Q12981 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
BNIP1Q12981 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
BNIP1Q12981 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
BNIP1Q12981 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
BNIP1Q12981 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
BNIP1Q12981 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
BNIP1Q12981 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
BNIP1Q12981 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
BNIP1Q12981 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
BNIP1Q12981 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
BNIP1Q12981 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
BNIP1Q12981 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC1□□□□□ -2.25
BNIP1Q12981 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC1□□□□□ -2.25
BNIP1Q12981 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC1□□□□□ -2.25
BNIP1Q12981 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC1□□□□□ -2.25
BNIP1Q12981 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC1□□□□□ -2.25
BNIP1Q12981 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
BNIP1Q12981 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC1□□□□□ -2.25
BNIP1Q12981 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC1□□□□□ -2.25
BNIP1Q12981 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1□□□□□ -2.25
BNIP1Q12981 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC1□□□□□ -2.25
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