Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CHD3Q12873 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
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