Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CASQ1P31415 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CASQ1P31415 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CASQ1P31415 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CASQ1P31415 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CASQ1P31415 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CASQ1P31415 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CASQ1P31415 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
CASQ1P31415 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
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CASQ1P31415 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CASQ1P31415 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CASQ1P31415 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
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CASQ1P31415 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
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CASQ1P31415 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
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CASQ1P31415 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CASQ1P31415 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
CASQ1P31415 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CASQ1P31415 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CASQ1P31415 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CASQ1P31415 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CASQ1P31415 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CASQ1P31415 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CASQ1P31415 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CASQ1P31415 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CASQ1P31415 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CASQ1P31415 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
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CASQ1P31415 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CASQ1P31415 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
CASQ1P31415 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
CASQ1P31415 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CASQ1P31415 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
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CASQ1P31415 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
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CASQ1P31415 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CASQ1P31415 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CASQ1P31415 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.31□□□□□ -2.46
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CASQ1P31415 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CASQ1P31415 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CASQ1P31415 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CASQ1P31415 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
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CASQ1P31415 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.32□□□□□ -2.46
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CASQ1P31415 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CASQ1P31415 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
CASQ1P31415 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
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CASQ1P31415 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CASQ1P31415 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CASQ1P31415 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
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CASQ1P31415 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CASQ1P31415 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CASQ1P31415 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CASQ1P31415 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CASQ1P31415 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
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