Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTPRMP28827 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTPRMP28827 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTPRMP28827 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTPRMP28827 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTPRMP28827 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTPRMP28827 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTPRMP28827 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTPRMP28827 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTPRMP28827 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTPRMP28827 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTPRMP28827 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTPRMP28827 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PTPRMP28827 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PTPRMP28827 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PTPRMP28827 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PTPRMP28827 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PTPRMP28827 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-0.74□□□□□ -2.53
PTPRMP28827 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
PTPRMP28827 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PTPRMP28827 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
PTPRMP28827 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PTPRMP28827 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PTPRMP28827 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PTPRMP28827 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PTPRMP28827 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PTPRMP28827 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PTPRMP28827 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PTPRMP28827 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PTPRMP28827 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PTPRMP28827 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PTPRMP28827 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PTPRMP28827 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PTPRMP28827 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC-0.75□□□□□ -2.53
PTPRMP28827 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PTPRMP28827 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC-0.75□□□□□ -2.53
PTPRMP28827 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PTPRMP28827 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PTPRMP28827 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PTPRMP28827 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PTPRMP28827 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PTPRMP28827 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PTPRMP28827 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PTPRMP28827 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PTPRMP28827 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PTPRMP28827 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PTPRMP28827 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
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PTPRMP28827 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PTPRMP28827 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PTPRMP28827 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PTPRMP28827 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PTPRMP28827 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTPRMP28827 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
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PTPRMP28827 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTPRMP28827 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
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PTPRMP28827 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
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PTPRMP28827 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
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PTPRMP28827 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PTPRMP28827 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
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PTPRMP28827 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PTPRMP28827 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
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PTPRMP28827 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPRMP28827 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPRMP28827 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPRMP28827 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPRMP28827 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPRMP28827 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPRMP28827 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPRMP28827 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPRMP28827 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPRMP28827 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPRMP28827 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPRMP28827 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPRMP28827 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPRMP28827 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPRMP28827 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPRMP28827 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
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