Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CLDN9O95484 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CLDN9O95484 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CLDN9O95484 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
CLDN9O95484 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
CLDN9O95484 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CLDN9O95484 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CLDN9O95484 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
CLDN9O95484 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
CLDN9O95484 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CLDN9O95484 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CLDN9O95484 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CLDN9O95484 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CLDN9O95484 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CLDN9O95484 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CLDN9O95484 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CLDN9O95484 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CLDN9O95484 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.72□□□□□ -2.29
CLDN9O95484 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CLDN9O95484 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CLDN9O95484 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CLDN9O95484 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CLDN9O95484 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CLDN9O95484 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CLDN9O95484 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CLDN9O95484 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CLDN9O95484 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CLDN9O95484 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.72□□□□□ -2.29
CLDN9O95484 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.7□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
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CLDN9O95484 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CLDN9O95484 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
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