Protein–RNA interactions for Protein: H3BP13

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LH3BP13 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.07□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
TRAPPC2LH3BP13 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
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