Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SH3BP4Q9P0V3 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
SH3BP4Q9P0V3 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
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